Kulturno-povijesni odjel je utemeljen 1995. godine, a sačinjavaju ga tri zbirke: povijesna, kulturno-povijesna i zbirka NOB-e.
Naime, do 1995. godine od povijesne muzejske građe u Muzeju je postojala samo manja zbirka NOB-e. Obzirom da je Knin grad izuzetno zanimljive i značajne prošlosti ne samo lokalno nego i u nacionalnim razmjerima započeli smo prikupljanje, istraživanje i obradu sveukupne povijesne, kulturno-povijesne muzejske građe od postanka grada u ranom srednjem vijeku do današnjih dana.
Tako danas povijesna zbirka ima više stotina raznovrsnih povijesnih muzejskih predmeta: staro oružje (hladno i vatreno), grafike s prikazom Knina 17. i 18. stoljeća, stare karte 18. i 19. stoljeća raznovrsnog sadržaja (topografske, specijal karte, karte poštansko-telefonske, cestovne i željezničke mreže, karte s tadašnjim državnim granicama, upravno-teritorijalnom podjelom i drugo), potom stare razglednice, koje su odličan pokazatelj urbanističkog razvoja i izgleda grada druge polovice 19. i prve polovice 20. stoljeća. Zbirka obuhvaća i stare dokumentarne fotografije i drugu dokumentarnu građu (izvorne dokumente) s kraja 19. i početka 20. stoljeća koje dijelom svjedoče o gospodarskom i kulturnom životu grada navedenoga vremenskog razdoblja.
U zbirci se nalaze i najnovija dokumentarna građa: fotodokumentacija i druga građa o Domovinskom ratu na kninskom području, te raznovrsni promidžbeni materijal od kampanja za izbore, prvenstveno lokalne, ali i one na državnoj razini.
Kulturno-povijesna zbirka obuhvaća raznovrsne stilske predmete, predmete umjetničkog obrta koji su se koristili u kućanstvu: namještaj, posuđe i drugi kućanski predmeti od porculana, keramike, metala, stakla s kraja 19. i početka 20. stoljeća, potom tehničke predmete s početka i prve polovice 20. stoljeća (gramofon, radioaparat, dijaprojektori, fotoaparati i slično).
Osamdesetih godina 20. stoljeća oformljena je manja zbirka muzejske građe iz razdoblja NOB-e na kninskom području. Zbirka obuhvaća dijelove oružja, naoružanja i vojničke opreme ( odjeća, pribor i slično), potom fotografije, negative NOB-e, te nešto malo izvornih dokumenata. U zbirci se nalazi priličan broj sekundarne muzejske građe (fotokopije i prijepisi izvorne arhivske građe) koja je prikupljana za potrebe povremenih izložbi i tada planiranog stalnog postava.